Dentro de la naturaleza del caribe, debemos distinguir varios ecosistemas, el más importante es el marino, con una impresionante biodiversidad, pero no debemos olvidar las selvas de algunas islas o de los países de América Central, también patrimonio caribeño y de la Humanidad, algunos de ellos para la UNESCO.

En el caribe encontramos más de 14,000 plantas, de las que el 50% son endémicas, las más destacadas son el aceituno, que encontramos en islas como la de Haití y República Dominicana, el guayacán en Jamaica, el Ceiba en Guatemala son algunos de los más destacados. En su flora marina destacamos los maravillosos fondos de posidonia, así como los arrecifes de coral, destacando la segunda barrera coralina más grande del mundo.

Si hablamos de su fauna, debemos destacar su endemismo, es una fauna subtropical, nacida y crecida aquí en muchos casos, y una fauna que no conoce otras latitudes, especies que se han generado a través de las corrientes marinas en el caso de la fauna marina, la más destacada con medio millar de especies entre las que destacan cetáceos, manatíes, barracudas..

También destacan las aves, tanto marinas como terrestres, con más de 700 especies distintas, muchas de ellas en peligro de extinción actualmente. Los reptiles, como el cocodrilo, los anfibios, los mamíferos como delfines o manatíes o ballenas en el mar, o los murciélagos en la tierra. Pero dentro del ecosistema marino hay que destacar los arrecifes de Coral, con más de 30,000 kilómetros cuadrados de arrecifes de coral, la de Belize es patrimonio de la Humanidad.

Estos arrecifes de coral, auténtica joya caribeña, están en la actualidad siendo protegidos por su debilidad y su delicada situación, actividades como la pesca descontrolada o el buceo o submarinismo clandestino sin control han dañado mucho esta maravilla de la naturaleza, lo que ha propiciado que actualmente se controle todo con esmero.